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Das Web Structure Mining ist eine Form des Web Mining. Beim Web Structure Mining wird ein Modell erstellt, welches einerseits bei der Kategorisierung und der Analyse des Rankings der Seite behilflich ist, andererseits aber auch Rückschlüsse auf Beziehungen und Ähnlichkeiten zwischen verschiedenen Websites erlaubt.
Es wird dabei nicht so großen Wert darauf gelegt, wie der User auf die Website gelangt (Web Usage Mining) und auch die Inhalte der Seiten (Web Content Mining) werden größtenteils nicht betrachet. Beim Web Structure Mining geht es vor allem darum, die Hyperlinkstruktur einer Webseite, also die "inter-document structure", zu erkennnen.
